Due anni dopo la fine del mondo come lo conosciamo, Shizuru conduce una vita tranquilla nella sua città natale di Agano. Ma un giorno, trova un indizio che la condurrà in un viaggio verso l'ignoto alla ricerca della sua amica scomparsa.

Shizuru e le sue amiche guidano il treno verso Ikebukuro alla ricerca del loro amico scomparso e si rendono conto di essere gravemente impreparati per il viaggio nello strano mondo oltre il loro villaggio.

Il treno arriva nella nebbiosa Higashi-Agano e le ragazze si abbandonano all'ospitalità dei simpatici residenti che si fanno crescere funghi dalla testa. Tuttavia, Akira sospetta che la città non sia così serena come sembra.

Il treno porta le ragazze attraverso diverse fermate popolate da strani residenti tutti diversamente trasformati dall'evento 7G. Nel frattempo, Akira cerca disperatamente di nascondere la cr...

Seguendo gli ordini del loro capo tiranno, il Boss, i soldati in miniatura di Inariyama legano Shizuru e Reimi per impedire loro di trovare il Dottore, l'unica persona che può salvare Akira.

Shizuru racconta l'ultima volta che ha parlato con Yoka prima di partire per Ikebukuro, e le tensioni tra le amiche crescono.

Reimi, Akira e Nadeshiko partono alla ricerca di Shizuru e escogitano un piano per salvarla dagli zombi e dalla loro regina degli zombi.

Le ragazze entrano nel mondo del programma televisivo «Alice in Nerima Land». Quando scoprono che le cose non vanno come dovrebbero essere, cercano di trovare Alice per riportare la pace nel...

Le ragazze scoprono di più su ciò che sta accadendo a Ikebukuro.

Le ragazze incontrano il padre di Shizuru, che ha lasciato Agano anni fa per scoprire perché il mondo si è trasformato. Le mette in guardia dagli abitanti di Shiinamachi, intenzionati a impedire a chiunque di entrare a Ikebukuro.

Le ragazze arrivano a Ikebukuro, solo per scoprire che Yoka non è affatto come la ricordano.

Pontaro scappa su un treno con Yoka per sfuggire alla responsabilità dell'incidente 7G, e le ragazze lo inseguono, rendendosi conto che solo Yoka da sola può spegnere il pulsante 7G e riportare il loro mondo alla normalità.