Parte la sconclusionata ricerca dello scomparso Mario Scafroglia, guidata dalla più che discutibile conduzione di Corrado Guzzanti, al quale si affianca in qualità di ospite fisso del programma il pacato Padre Federico. Tra le parodie della puntata, quelle che prendono di mira l'allora ministro dell'Economia Giulio Tremonti e noti volti della TV come Enrico Ghezzi e Gabriele La Porta.

Guzzanti prosegue nella sua conduzione approssimativa del programma dedicato alla misteriosa vicenda di Mario Scafroglia, preferendo però parlare di un tema ben poco attinente, gli errori bancari, sempre trattato in maniera risibile. Altri momenti esilaranti sono affidati alle apparizioni del massone con le sue oscure direttive ai confratelli e di Lorenzo in veste di critico cinematografico.

L'improbabile conduzione di Guzzanti è distratta dalla presenza del suo domestico filippino: il programma prosegue comunque con l'intervento di Vulvia di Rieducational Channel, che lancia il primo episodio della saga dei "Fascisti su Marte", ovvero la storia dell'invasione italiana sul pianeta rosso...

In questa puntata la cantante Fiorella Mannoia è ospite di Corrado Guzzanti, che però si preoccupa più di molestarla che di intervistarla. In studio anche una surreale Miss Italia interpretata da Caterina Guzzanti, che suscita l'ammirazione del bistrattato Padre Federico.

Nel tentativo di rilanciare la fiacca inchiesta sulla scomparsa di Mario Scafroglia, Guzzanti improvvisa uno scoop proponendo come testimone informato sui fatti il proprio domestico filippino. Vediamo poi un mafioso sotto processo effettuare una serie di provini per scegliere il magistrato dal quale lasciarsi giudicare, mentre il ministro dell'Economia Tremonti cerca di far tornare i conti giocando al videopoker.

Vulvia di Rieducational Channel introduce un nuovo episodio della serie "Fascisti su Marte", con la sgangherata pattuglia di camice nere in esplorazione sul pianeta. In studio intanto il conduttore Guzzanti continua a divagare rispetto allo scopo originario della trasmissione, in compagnia dei suoi ospiti Miss Italia e Padre Federico.

All'inizio della puntata lo studio del programma è occupato dal capo massone, che si impadronisce della conduzione imponendo il cappuccio anche agli ospiti. Quando finalmente la trasmissione riprende normalmente, Guzzanti propone di cercare il povero Mario Scafroglia perfino nell'Iraq di Saddam Hussein, dove è in corso l'ispezione ONU per verificare la presenza di armi di distruzione di massa: ecco quindi il vice del dittatore, Tareq Aziz, guidarci nelle infinite stanze della sua casa per dimostrare che non nasconde nulla...

Gli sforzi della trasmissione per ritrovare Mario Scafroglia sono ormai disperati: si tenta un bizzarro identikit, poi il conduttore Guzzanti decide di ricorrere addirittura ad una sensitiva cinese. Nel frattempo c'è spazio per un esorcismo, richiesto al solito padre Federico perché ritenuto la persona giusta per "parlare con i giovani", e per un Francesco Rutelli in preda a dubbi amletici.

Puntata speciale interamente dedicata alle imprese dei "Fascisti su Marte": vengono ricapitolati gli episodi già narrati dell'italica epopea extraterrestre, con l'aggiunta degli antefatti della missione, prima della partenza e nel corso del viaggio a bordo del "prototipo di missile tedesco".

In questa puntata Antonio Albanese interpreta un elettore della Casa delle Libertà, la coalizione guidata da Silvio Berlusconi allora al governo del Paese: malgrado l'evidente stato d'alterazione Guzzanti lo intervista in merito ai provvedimenti approvati dalla maggioranza. Torna poi come ospite Fiorella Mannoia, ma anche questa volta la cantante subisce le eccessive attenzioni del conduttore.

In apertura di puntata Guzzanti, invece di condurre, preferisce dilungarsi in una telefonata personale, almeno fino a quando un agente speciale dei NOCS russi non fa irruzione in studio, in cerca del consiglio di amministrazione della Rai...

Questa volta Guzzanti non c'è e padre Federico si ritrova solo: il conduttore dovrebbe essere a letto ammalato, ma quando dallo studio cercano di collegarsi con lui trovano in casa invece il domestico filippino.

Il conduttore e padre Federico per la rubrica "Seminiamo bene" esclamano a gran voce lo slogan per i giovani "Violenza, via, brutto!". Affrontano poi il tema della verginità con l'ospite Caterina Guzzanti che interpreta Miss Italia.

Lorenzo introduce la puntata parlando dell'ultimo film di Harry Potter. Il conduttore millanta di aver quasi trovato Mario Scafroglia e, per accelerare le ricerche, ha adottato un "cucciolo di NOCS". In collegamento Guzzanti nei panni dello stratega americano Luttwak che strappa un'abiura a un no-global.

In questa breve puntata il conduttore Guzzanti ragiona su degli slogan contro la droga assieme a Padre Federico. Interviene telefonicamente un telespettatore che travisa tutto e argomenta senza senso.

Dalla devolution al mondo del lavoro, dall'attenzione alla guida alla provvidenza, i grandi temi toccati in modo un po' confuso dal Corrado Guzzanti e padre Federico. Il massone incappucciato interrompe la trasmissione e annuncia il sacco di Roma; prosegue la missione di conquista di Marte da parte del manipolo di militanti fascisti.

A Silvio il mafioso Guzzanti spiega di essere disposto a dare lavoro agli operai Fiat licenziati. Padre Federico e Guzzanti nei panni del conduttore parlano dei fondi pubblici destinati alla scuola. Il massone incappucciato dà perentori consigli ai telespettatori sulle trasmissioni da seguire.

Il conduttore si accorge di star leggendo la scaletta di Excalibur e gli compare un angelo (Caterina Guzzanti) che lo scambia per Antonio Socci. A Vulvia la presentazione delle ultime notizie su Rieducational Channel e, in seguito, con padre Federico alias Jhonny Cloaca e la dottoressa Acceprane, un'indagine sulla psiche di Dio. Dopo un'altra puntata della saga della conquista di Marte, il rientro in studio fra censura, liberismo, marxismo, e chi più ne ha più ne metta.

Il militante fascista Guzzanti alla conquista del pianeta rosso Marte, annuncia che l'indomani andrà in onda l'ultima puntata del programma. Anche il resto della puntata si svolge sul "pianeta sovietico", dove è arrivato un balilla che "perturba la maschia onda mentale" del Gerarca Barbagli.

Per l'ultima puntata de "Il caso Scafroglia", un bilancio di fine anno incentrato soprattutto sul tema della delinquenza. Il colpo di scena finale sarà svelato da Marzocca e da Caterina Guzzanti nei panni di due psicologi, che comunicano a Corrado che in realtà lui non è un conduttore televisivo e che non esiste alcun caso Scafroglia.