L'Unità è una squadra segreta di agenti delle Forze Speciali statunitensi che deve compiere missioni in tutto il mondo. L'ultimo arrivato è Bob Brown, che si unisce alla squadra di Jonas per salvare un aereo di linea pieno di uomini d'affari europei che sono stati dirottati dai terroristi. Nel frattempo, Kim, la moglie di Bob, è alle prese con il controllo che l'Unità ha sulla sua vita personale.

La squadra, senza Bob, è alla ricerca di un satellite cinese caduto. Questo si trasforma rapidamente in un'opportunità per catturare uno dei terroristi più ricercati al mondo. Nel frattempo, Bob viene interrogato sul ruolo dell'Unità nel salvataggio dell'aereo dirottato. Molly decide di visitare lo psichiatra dell'Unità per parlare della sparatoria avvenuta a casa sua. Kim è frustrata per il trasloco e poi conforta una donna che ha appena saputo che il marito è morto in combattimento.

Jonas cerca di salvare un gruppo di missionari americani nascosti in Indonesia. Tuttavia, si rende presto conto che la missione richiederà più uomini del previsto. Alla base, Mac finisce per essere colpito da Bob durante un'esercitazione e Molly, Kim e Tiffy si preparano a ospitare un senatore in visita.

L'Unità viene inviata a Los Angeles per proteggere il ministro della droga messicano, che è stato minacciato di essere assassinato e presto la moglie e i figli vengono rapiti. Alla base, un'ex moglie dell'Unità fa la sua ricomparsa nella speranza di attirare i membri dell'Unità. Tiffy si arrabbia quando Ryan ordina a Mack di prendersi una pausa.

Jonas e la squadra eseguono l'assassinio di un terrorista in Spagna. Tuttavia, scoprono presto che il governo ha annullato la missione e non li proteggerà più nel Paese, il che significa che l'unica speranza è la fuga. Tornati alla base, Molly viene a sapere che sua figlia Betsy vuole abbandonare l'università e Kim pensa di frequentare lei stessa un corso universitario.

L'Unità deve cercare di far arrivare un dispositivo di ascolto a un agente all'interno dell'ambasciata iraniana dove si stanno incontrando diplomatici statunitensi, iraniani e russi. Molti ipotizzano che i russi stiano cercando di vendere agli iraniani il materiale per costruire un'arma nucleare. Nel frattempo, alla base, Tom cerca di porre fine alla sua relazione con Tiffy, ma lei non lo ascolta e Kim nota Tiffy in una stanza di motel e non sa cosa fare.

L'equipaggio deve volare in Afghanistan per assassinare un alto membro dei Talebani. Tuttavia, uno degli elicotteri della squadra finisce per precipitare in territorio nemico, mettendo in pericolo l'intera squadra. Tornati alla base, Molly affronta un amico e veterano dell'Unità in pensione riguardo alla sua dipendenza dagli antidolorifici e Kim finisce per ottenere un lavoro alla stazione radio locale.

L'unità entra nel corso di addestramento SERE (Survival, Evasion, Resistance Escape) e viene fatta credere che saranno guardie. Il gruppo è presto scioccato nello scoprire che in realtà sono prigionieri di guerra per un periodo di tempo indeterminato.

Jonas e la sua squadra devono rintracciare dei missili terra-aria prima che vengano contrabbandati fuori dal Brasile dopo che un accordo con un signore della droga è saltato. Jonas viene aiutato da un ragazzo del posto che informa la squadra su dove i SAM sono stati portati per essere spediti. Nel frattempo, alla base, Kim finisce per causare ancora più problemi quando insiste che il "Gruppo di preparazione familiare" si occupi di ciò che lei ritiene più grave. Inoltre, Williams cerca di trovare un modo per dire alla donna che vuole sposare che in realtà è un membro dell'Unità e non un impiegato della base come lei crede.

Dopo che Bob fa saltare la sua copertura in Africa, dice a Jonas di annullare una visita di un dignitario nella zona a causa del pericolo. Tuttavia, il funzionario si rifiuta e si scopre subito qualcosa di sconvolgente sul motivo per cui vuole davvero andare lì. Nel frattempo, Kim ha un incontro alla stazione radio e a Molly viene offerta un'opportunità immobiliare.

Keith Soto torna alla base per una riunione e Jonas e il Col. Tom Ryan scoprono subito che è un giornalista che sta scrivendo un articolo che smaschererà l'Unità. Jonas decide che c'è un solo modo per convincerlo a non pubblicare l'articolo. Nel frattempo, con l'aiuto di Tiffy e Kim, Molly rintraccia la donna che ha truffato 40.000 dollari del fondo di investimento delle donne.

L'Unità viene chiamata per una consulenza su una bomba piazzata in una banca di Atlanta, ma ben presto scopre che l'ordigno potrebbe essere nucleare. Nel frattempo, Bob e Kim decidono di prendersi una necessaria vacanza, ma Kim scopre presto che Bob l'ha portata via per una missione e vuole che lei lo aiuti.

L'Unità finisce per arrestare un ex generale jugoslavo ricercato per crimini di guerra e lascia che le Nazioni Unite si prendano il merito della loro cattura. Tuttavia, il criminale sfugge presto alla custodia delle Nazioni Unite e cerca di vendicarsi di Jonas per averlo catturato. Nel frattempo, alla base, Tiffy è convinta che Mack abbia deciso di tornare nell'Unità e sta pensando di divorziare, mentre Kim riceve una notizia sconvolgente.