Norman Osborn è tornato a essere Goblin, il folletto verde, e minaccia di trasformare tutti gli abitanti di New York in mostri pazzi e pericolosi come lui. Per provare la sua nuova formula ha rapito sua nipote, Moira Osborn, e l'Uomo Ragno accorre per salvarla trovandosi di fronte Goblin. Per fortuna ci sono i suoi fantastici amici ad aiutarlo: l'Uomo Ghiaccio e Stella di Fuoco.

Kraven il Cacciatore vuole distruggere New York servendosi dei dinosauri della Terra Selvaggia, portando alcune uova in America. Per farle dischiudere e comandare le gigantesche creature ha però bisogno della fonte di calore più grande della Terra: il raggio di Stella di Fuoco. Peter e Bobby cercano di mettere in guardia Angelica da Kraven, ma lei è attratta dal suo fascino selvaggio e non si accorge che il supercriminale intende rapirla e utilizzarla per i suoi loschi fini.

Il Dottor Doom vuole impadronirsi di un medaglione magico che fornisce a chi lo possiede il potere di far avverare qualsiasi cosa egli desideri. Accidentalmente il medaglione finisce però nelle mani dell'imbranato signor Frump, che ne sfrutta il potere per soddisfare tutto quello che gli manca nella vita. Frump viene poi manovrato da Doom per eliminare i fantastici amici, rivelandosi essere un avversario ben più pericoloso e imprevedibile dello stesso sovrano di Latveria.

Stella di Fuoco si è presa una cotta per Shiro Yoshida, alias il mutante Alba di Fuoco (Sole Ardente), il cui perfido zio è intenzionato a usare il potere del nipote e della ragazza per liberare un orrendo mostro infuocato e conquistare il mondo di occidente. Quando Shiro comprende le maligne intenzioni dello zio decide di aiutare Angelica, Peter e Bobby, ma è troppo tardi: il mostro di fuoco ha sottratto loro i poteri mutanti ed è stato liberato per distruggere New York.

Un meteorite è caduto sulla Terra. Al suo interno c'è un'entità aliena detta Swarm che prende possesso della api terrestri mutandosi in un gigantesco insettoide capace di trasformare in uomini ape al suo servizio tutti coloro che colpisce. Anche Uomo Ghiaccio e Stella di Fuoco vengono colpiti dal raggio e trasformati, così resta solo l'Uomo Ragno a fronteggiare la minaccia aliena ed è anche costretto a lottare contro i suoi fantastici amici.

Il Camaleonte vuole annientare tutti i suoi peggiori nemici che da anni ostacolano la sua attività criminale ed ha preparato una trappola mortale per Capitan America, Namor il Sub-Mariner, il Dottor Strange, Shanna e naturalmente Spider-Man, con i suoi Fantastici Amici Uomo Ghiaccio e Stella di Fuoco. Sette piccoli supereroi cadono così nella sua trappola mortale.

Electro ha riattivato Video-Man facendolo uscire dai videogame della sala giochi e usa il mostro elettronico per compiere furti in città. Flash Thompson resta intrappolato in un videogioco e, nel tentativo di fermare Electro, anche l'Uomo Ghiaccio e Stella di Fuoco fanno la stessa fine. Come se non bastasse, Flash ha visto Angelica trasformarsi e ha scoperto l'identità di Stella di Fuoco.

Magneto, il perfido signore del magnetismo, vuole far prevalere i diritti dei mutanti con la forza, e chiede la liberazione di Blob, Toad e Mastermind dalla prigione federale per poter ricostituire la sua Confraternita dei Mutanti Malvagi. Uomo Ragno, Stella di Fuoco e Uomo Ghiaccio dovranno così vedersela con uno dei mutanti più potenti al mondo.

L'Incredibile Hulk incontra i fantastici amici. L'Uomo Ragno viene scritturato da Stan Blockbuster, un famoso regista di Hollywood, per recitare la sua parte in un film. Peter decide di accettare per poter guadagnare i soldi necessari per aiutare zia May a pagare le rate della casa, ma non sa che tutto il set è una terribile trappola di Mysterio, il signore delle illusioni, per poterlo uccidere. Anche Bruce Banner si trova ad Hollywood ed Hulk sta per fare la sua trionfale apparizione in scena.

Loki, il malvagio fratello di Thor, vuole vendicarsi dell'odiato dio del tuono e distruggere Midgard, la Terra che lui tanto desidera proteggere. A questo scopo ha recuperato le Pietre degli Dei, con cui acquisisce un grande potere che gli permette di spedire Thor ad Asgard e prendere le sue sembianze. L'Uomo Ragno e Stella di Fuoco finiscono prigionieri delle pietre magiche di Loki, mentre l'Uomo Ghiaccio si ritrova da solo ad Asgard nel regno dei giganti di ghiaccio, e deve fare di tutto per ritrovare il vero Thor e salvare la Terra.

Modred il malvagio vuole conquistare la nostra dimensione e solo il leggendario Cavaliere Nero può fermare il mago malvagio e la sua orribile armata di demoni. La Spada Lucente è l'unica arma che può sconfiggere Modred e impedirgli di ritornare sulla Terra dalla dimensione in cui è stato intrappolato molti secoli or sono dal Mago Merlino. Un'incredibile avventura medievale aspetta l'Uomo Ragno e i suoi fantastici amici.

Kingpin, il re del crimine, intende rubare un'arma sperimentale del governo statunitense e per compiere il furto intende servirsi di Capitan America. Per costringere il paladino della giustizia a collaborare con lui, lo ipnotizza grazie a un chip ipnotico progettato dal folle Dottor Faustus con cui il Capitano obbedirà ai suoi ordini per almeno dodici ore. Anche l'Uomo Ghiaccio viene ingannato credendo di essere stato scelto da Capitan America per compiere una missione top secret.

Red Skull, il famoso criminale di guerra, vuole ritrovare il tesoro perduto dei nazisti. L'Uomo Ragno, Uomo Ghiaccio e Stella di Fuoco dovranno affrontare una pericolosa avventura per impedire al malvagio Red Skull di raggiungere il suo obiettivo.