L'amore tra il commissario Santamaria e l'ispettore Morini è un colpo di fulmine che li conduce velocemente all'altare, ma la coppia è costretta a sospendere all'aeroporto di Roma il viaggio di nozze per Santo Domingo a causa della morte, in un rogo, di una donna nota ai due, Giulia Lisetti. In seguito viene ucciso Maffei, un vivaista socio d'affari della Lisetti, e dei due omicidi viene sospettato il clan mafioso dei Vergara. Nel frattempo la PM Lorenza Alfieri, ex fidanzata di Diego, sembra non voler accettare il matrimonio e fa di tutto per introdursi nella vita dei due.

All'interno del museo del Ghetto viene trovato il cadavere del direttore, Arturo Melodia, sotto a degli orribili graffi ti antisemiti. Gli autori dei graffiti sarebbero dei ragazzi neonazisti, ma l'assassino non si trova ancora.

Una psichiatra, Irene Mainetti, viene trovata uccisa nel suo appartamento poco prima del suo matrimonio. Il principale sospettato è Francesco, un suo paziente al quale viene data la caccia.

Viene trovato il corpo di una ragazza ucraina sulle rive del Tevere. Diego e Stella indagano negli ambienti frequentati della giovane, soprattutto nella casa nella quale lavorava come domestica, dove una sua connazionale lavora ancora come babysitter.

Durante un semplice prelievo in banca, Diego viene ferito da un colpo di pistola nel tentativo di salvare una bambina. Fortunatamente non viene colpito nessun organo vitale e Lorenza gli dona anche il suo sangue per salvargli la vita.

Il corpo di un noto truffatore viene trovato carbonizzato nella sua auto. Questo porta ad un giro di traffico di opere d'arte e Stella interviene in prima persona per riuscire a risolvere il caso.

Su una panchina di Villa Borghese viene trovata morta un giovane avvocato, Iris Agliardi, impegnata in quei giorni con un caso di stupro. Il principale indiziato non può essere che il ragazzo accusato, ma il padre di Stella complica le cose in quanto è l'avvocato dello stesso ragazzo.

Viene trovato morto il proprietario di un barcone sul Tevere. I sospetti cadono sull'ex marito della convivente della vittima e sembra essere coinvolto anche il figlio di Lojacono. Diego intanto organizza una gita in Spagna con la moto insieme agli amici, ma Stella vuole ristrutturare il bagno.

In un circolo di tennis viene trovato il cadavere del direttore. Principale sospettato è il fratello di Lorenza, maestro di tennis, che sembra avere buone ragioni per volere la morte del capo.

Fra le rovine di una tomba etrusca viene trovato il corpo di una giovane ragazza. Mentre le indagini girano intorno all'ambiente universitario e dei tombaroli, il matrimonio tra Stella e Diego è in crisi. Stella vuole un figlio ma Diego non si sente ancora pronto così lei torna a casa dei suoi. Diego incontra dopo tanto tempo il suo compagno di banco del liceo che adesso è diventato il direttore del Museo Etrusco.