Deciso a diventare un samurai, Usagi parte per Neo Edo, dove però finisce per liberare un mostro dalla sua prigionia millenaria.

Usagi e isuoi amici combattano contro Kagehito, uno Yokai simile a un ragno con braccia, gambe e occhi su tutto il corpo e devono salvare Lord Kogane da un attacco.

Usagi, Kitsune, Chizu e Gen vanno al museo culturale e incontrano alcuni Yokai che abitano i luoghi abbandonati e uno Yokai che può cambiare forma.

Mentre Gen è in ospedale, Usagi e Kitsune finiscono nel mezzo di una lite tra i Mogura e la Squadra Pipistrelli.

Karasu-Tengu accetta di diventare la sensei di Usagi se lui riesce a catturare tre Yokai urbani. Lady Fuwa ruba la Pietra-Ki e avvia il suo piano per controllare Neo Edo.

Il Clan Ninja dei Neko attacca il tempio, costringono Chizu a prendere una posizione. Gen ha un altro lavoro da sbrigare e Usagi cerca il secondo Yokai.

Quando Usagi e Chizu vanno alla ricerca dell'ultimo Yokai urbano nel Dojo Nascosto, Usagi ha un ripensamento. Kagehito è sempre più vicino al suo obiettivo.

Chikabuma avvisa in segreto Gen, Toshiko, Chizu e Kitsune del piano di Kagehito. Usagi si dimostra all'altezza del ruolo, così Karasu-Tengu decide di addestrarlo.

Usagi torna nel team per combattere Lady Fuwa e i suoi ninja. Kagehito lancia un assalto feroce per attaccare il Clavis alla Pietra-Ki.

La Pietra-Ki cerca di chiudere il portale a possibili invasori alieni, ma ha bisogno del pezzo mancante. Riusciranno Usagi e i suoi amici a trovarlo in tempo?