Autunno 1937. Ignorando le obiezioni dell'Esercito Imperiale, il tenente colonnello Yuuki fonda l'organizzazione di addestramento spie "Agenzia-D". L'Esercito, avendo bisogno di un contatto con l'Agenzia-D, invia il tenente Sakuma, il quale si trova ad assistere ai massacranti processi di selezione così facilmente superati dai potenziali candidati. Poco dopo, il colonnello Mutou ordina a Sakuma di perquisire la casa di un uomo sospettato di essere una spia americana, il giapponofilo John Gordon. I membri dell'Agenzia-D, camuffati da agenti di polizia militare, vengono guidati da Sakuma nella loro prima missione.

La perquisizione dell'abitazione di Gordon risulta in un nulla di fatto. Quando l'americano si lascia sfuggire che si tratta della seconda perquisizione a cui è stato sottoposto, Sakuma si rende conto che tutta la missione dev'essere stata architettata da Mutou.

Un uomo si risveglia con un'amnesia totale. Gli unici indizi in suo possesso sono un passaporto a nome "Shimano Ryuunosuke" e il porto a cui è approdato: Marsiglia. Parlando con Alain, il misterioso individuo lì insieme a lui, scopre che la Francia è stata occupata dall'esercito tedesco.

Il Sergente Honma Eiji è stato assegnato alla sezione di Shanghai della polizia militare. Poco dopo aver fatto rapporto al suo nuovo incarico viene fatto chiamare dal Capitano Oikawa Masayuki. Oikawa ordina a Honma di procedere con un'indagine interna per scovare un agente nemico che sospetta si sia infiltrato fra le loro fila. Mentre sta spiegando i dettagli della missione, i due sentono un'esplosione...

Izawa Kazuo, gestore di un modesto studio fotografico a Londra, conduce una vita piuttosto tranquilla... almeno fino al momento in cui, senza il minimo preavviso, viene arrestato con l'accusa di spionaggio. Durante il massacrante interrogatorio a cui Isawa viene sottoposto, di fronte a lui si presenta il Tenente Colonnello Howard Marks, capo della sezione di spionaggio dei Servizi Segreti Britannici.

All'Agenzia-D arriva un'urgente richiesta di incontro proveniente da un collaboratore, Morozoff, che sostiene di avere importanti informazioni riservate da condividere. Un agente dell'Agenzia-D, Seto Reiji, organizza un incontro con Morozoff, che avverrà sul treno espresso speciale "Asia", delle Ferrovie della Manciuria Meridionale.

La Tokimaru, una nave da crociera di lusso, è partita da San Francisco alla volta del Giappone, in un viaggio che la porterà a fermarsi presso tutte le isole hawaiiane che troverà sulla sua strada. Utsumi Osamu si sta rilassando sul ponte della nave, intento a godersi uno schema di parole crociate, quando viene avvicinato da un uomo che si presenta come Jeffrey Morgan. Proprio in quel momento, dai passeggeri affacciati ad ammirare l'oceano si alza un grido di terrore.

Shirahata Kiichiro, un ex diplomatico, è sospettato di essersi appropriato di un importantissimo segreto militare dell'Esercito Imperiale: la "Grande Strategia". Nel corso delle sue indagini segrete, Gamou Jirou si mette in contatto con un vecchio amico di Shirahata, il Console britannico Ernest Graham.

È una vera guerra fra spie, fra l'Agenzia-D e l'Agenzia del Vento, mentre gli agenti di entrambe le organizzazioni fanno di tutto per recuperare la "Grande Strategia" del Giappone prima che finisca nelle mani sbagliate.

Aaron Price, il corrispondente del British Times nell'estremo oriente, indaga sulla vera identità del Tenente Colonnello Yuuki, l'uomo che si dice abbia fondato l'Agenzia-D. Sfogliando la lista degli ex allievi dell'Accademia Militare Privata, il suo occhio cade su di un ragazzo entrato con un esame superato a pieni voti, ma poi espulso per comportamenti violenti. Il suo nome? Arisaki Akira.

Hermann Wolff, un Colonnello della Wehrmacht assegnato all'Abwehr, la divisione di spionaggio dell'esercito tedesco, sta indagando insieme al suo aiutante, il Tenente Johann Bauer, sul deragliamento di un treno avvenuto poco fuori Berlino. Insospettito da alcuni dettagli, Wolff trova fra le proprietà di uno dei passeggeri un oggetto comunemente usato dalle spie professioniste. Sotto interrogatorio, il possessore dell'oggetto ammette di averlo rubato ad un giapponese, un tale "Maki Katsuhiko"...

Karl Schneider, corrispondente del Berlin Allgemeine, è sospettato di essere un doppio agente per Germania e Unione Sovietica. Mentre l'Agenzia-D sta indagando per trovare prove delle sue attività di spionaggio, Schneider muore in circostanze misteriose. Per scoprire la verità, il Tenente Colonnello Yuuki affida a ognuno dei suoi uomini una missione specifica.