Il dottor Allen Hynek viene reclutato nel programma di indagine top-secret sugli UFO dell'Air Force e indaga sul caso di un pilota militare sopravvissuto a un combattimento aereo con un velivolo alieno.

Hynek e Quinn indagano su un caso del West Virginia di una madre e dei suoi due figli che hanno assistito all'emersione di un essere alieno da un infuocato relitto UFO.

Hynek e Quinn vengono portati a Lubbock, in Texas, quando i cittadini assistono a un misterioso velivolo a forma di V nel cielo notturno.

Un bizzarro incontro UFO con un aereo di linea commerciale porta Hynek e Quinn a un programma top-secret che coinvolge scienziati ex nazisti.

Una serie di strani indizi portano Hynek e Quinn a un gruppo segreto che afferma di aver assistito a strane luci durante il combattimento, e un modo per contattarli.

Dopo che misteriose palle di fuoco verdi hanno quasi causato un disastro nucleare, Hynek e Quinn devono indagare su come sia potuto accadere.

Hynek indaga sulla scomparsa di un capo scout dopo che lui e la sua truppa hanno assistito a una strana imbarcazione in bilico nei boschi; Quinn viene trascinata in una missione canaglia per conto di Harding.

Hynek e Quinn indagano su un film che documenta un plotone dell'esercito sotto attacco UFO, e scoprono che i soldati non solo soffrono degli effetti fisici della guerra, ma anche psicologici.

Un uomo, che afferma di essere stato rapito dagli alieni, e sua moglie arrivano al quartier generale e tengono Hynek e Quinn in ostaggio finché non scoprono la verità.

Washington D.C. è invasa dagli UFO e Hynek e Quinn devono scoprire la vera natura della minaccia prima che sia troppo tardi.