Brock è tornato a Plumbeopoli dopo le sue avventure nella regione di Johto, ma trova suo padre Flint rintanato nella periferia della città. Il padre lo avverte che sta per succedere qualcosa di terribile.

Misty è tornata a Celestopoli (Cerulean City) per proporsi come Capopalestra.

Dal suo minaccioso castello, uno scienziato pazzo invia un robot gigante contro il villaggio ai piedi della collina. Gli abitanti danno l'allarme, temendo che il robot possa rovinare i raccolti.

Nel laboratorio del Prof. Oak, Tracey e il professore sono impegnati con le loro attività quotidiane e non si accorgono che l'elicottero del Team Rocket è atterrato a poca distanza.

Misty ha un problema: il suo Psyduck non sa nuotare. Ha proprio il terrore dell'acqua! Pertanto, quando Tracey decide di visitare la Palestra di Celestopoli (Cerulean City), i due Allenatori danno lezioni di nuoto allo Psyduck, ma con scarsissimo successo.

All'interno di una città affollata, i Pichu Bros. stanno radunando per giocare tutti i loro amici: Smoochum, Wooper, Magby e Teddiursa.

Richie, un amico di Ash, si reca nel laboratorio del Prof. Oak per chiedergli un consiglio, ma trova solo Tracey; il professore è in visita alle Isole Spumarine (Seafoam Islands) per partecipare in diretta a un programma TV.

Meowth vuole godersi i suoi ultimi giorni di vacanza con un picnic nel parco. A un tratto, il suo sandwich inizia a volare per aria, schizzando via quando Meowth prova ad acchiapparlo!

Celestopoli (Cerulean City) è il luogo in cui si svolgono tutte le vicende: Margi, la sorella di Misty, è finalmente tornata a casa, Butch e Cassidy intendono rapire un Delcatty, mentre Tracey e Casey, l'Allenatore amante del baseball proveniente dalla regione di Johto, sono in visita alla Palestra.

Incappato nell'ennesima disfatta, James trova un tappo di bottiglia che gli riporta alla memoria i suoi giorni di allenamento, facendo rivivere a tutti i membri il ricordo del loro periodo di apprendistato nel Team Rocket.

Richie e Sparky sono in una grande città, dove il più vicino Centro Pokémon è ormai prossimo alla demolizione.

Una giornata tranquilla presso il laboratorio del Prof. Oak si trasforma in un grande caos quando alcuni piccoli incidenti seminano il panico tra i Tauros!

Il Prof. Oak e Tracey stanno visitando l'isola in cui Gary è impegnato a condurre delle ricerche, quando s'imbattono in un Aerodactyl infuriato.

Butch e Cassidy del Team Rocket hanno ricevuto dei nuovi ordini: rapire un Luvdisc dalla Palestra di Celestopoli (Cerulean City)!

Dopo la decima sconfitta di fila degli Electabuzz, Casey è preoccupata per il futuro della sua squadra di baseball preferita.

Richie si trova sulla M/N Anna quando un gruppo di Gyarados selvatico blocca il proseguimento della nave.